R语言教程

本节介绍从分类变量创建频率和应急表，以及独立性测试，关联度测量和图形显示结果的方法。 生成频率表 R提供了许多创建频率和应急表的方法。下面介绍三种。在下面的例子中，假设A，B和C表示分类变量。 表 可以生成使用频率表表（）函数，使用所述比例的表prop.table（）使用的功能，和边际频率margin.table（） 。 # 2-Way Frequency Table attach(mydata)mytable <- table(A,B) # A will be row … 继续阅读“R语言教程之频率和交叉表Frequencies and Crosstabs”

第一篇目录 TCGA数据源 查看有多少不同的癌症数据集 查看任意数据集的样本列表方式 查看任意数据集的数据形式 选定数据形式及样本列表后获取感兴趣基因的信息 选定样本列表获取临床信息 综合性获取 从cBioPortal下载点突变信息 从cBioPortal下载拷贝数变异数据 把拷贝数及点突变信息结合画热图 同理还可以下载所有其它TCGA的数据进行后续分析。 正文 TCGA数据源 众所周知,TCGA数据库是目前最综合全面的癌症病人相关组学数据库，包括的测序数据有： DNA Sequencing m … 继续阅读“R语言教程之R的cgdsr包获取TCGA数据”

NLP（自然语言处理）中的一个常见任务是标记化。“令牌”通常是单个词（至少在像英语这样的语言中），“标记化”是将文本或一组文本分解成单个词。然后将这些令牌用作其他类型分析或任务的输入，如解析（自动标记单词之间的语法关系）。 在本教程中，您将学习如何： 将文本读入R 只选择某些行 使用tidytext软件包对文本进行标记 计算令牌频率（每个令牌在数据集中出现的频率） 编写可重复使用的功能来完成上述所有操作，并使您的工作具有可重复性 在本教程中，我们将使用双语儿童英语口语的转录语音。您可以在此数据集 … 继续阅读“R语言教程之NLP（自然语言处理） 标记化”

概览 为了绘制交通流量图，我们先要获得任意两个结点之间，交通的密集程度。随后我们把结点匹配到地图上，并依据不同交通密集程度给结点着以不同颜色，最终完成流量图。 安装库 本次推送用到的库包括plyr、ggplot2和maptools。以plyr为例，安装方法为： install.packages('plyr') 下载数据 本次推送需要用到的数据为英国地图和交通始发地及目的地数据。读者可以点击http://ingrid.geog.ucl.ac.uk/~james/msoa_popwe … 继续阅读“R语言教程之绘制交通绘制交通”

决策树是一种用分支结构表示选择及其结果的算法。结合图形，它能对数据结构进行描述，并生成预测和分类，从而帮助我们去了解哪些变量符合模型预设条件，以及哪些变量所起作用最大。本文通过R语言内置的readingSkills来进行决策树的演示：该数据集中的变量描述了某人的阅读能力得分(Score)、年龄(age)、鞋码(shoeSize)以及该人是否为母语者(nativeSpeaker)。我们根据得分、年龄和鞋码通过决策树预测该人为母语者的可能性大小。 简介 R语言中，我们可以利用party包实现决策树功 … 继续阅读“R语言教程之利用party包实现决策树功能”

本文简单介绍如何利用R绘制热力地图和连线（迁徙）地图，具体代码如下： 热力地图： l ibrary(REmap) setwd("F:\\Dropbox\\R\\公众号\\map") data<- read.csv(file="cityvaluetop10.csv",header=T) options(remap.js.web=T) ##设定工作环境，导入程序包并读取数据 ##options(remap.js.web=T)是将结果保存在工作目 … 继续阅读“R语言教程之利用R快速绘制热力地图and连线迁徙地图”

人们学习R语言时普遍存在缺乏系统学习方法的问题。学习者不知道从哪开始，如何进行，选择什么学习资源。虽然网络上有许多不错的免费学习资源，然而它们多过了头，反而会让人挑花了眼。 为了构建R语言学习方法，我们在Vidhya和DataCamp中选一组综合资源，帮您从头学习R语言。这套学习方法对于数据科学或R语言的初学者会很有用;如果读者是R语言的老用户，则会由本文了解这门语言的部分最新成果。 R语言学习方法会帮助您快速、高效学习R语言。 前言 在开始学习之前，第一个要回答的问题是:为什么要用R语言？或者 … 继续阅读“R语言教程之九个步骤教你轻松成Master”

方法简介 我们以加拿大的13个省级行政单位的GDP增长率为例，绘制GDP的空间分布填色图。大致思路如下：我们先把省份 – 地理坐标对应关系找到。接着，准备好2015-16年的各省GDP年增长率，随后将其与地图中的每个省一一匹配，做成GDP – 省份的对应关系。这样GDP就可以经由省份对应到地理位置上。最后根据增速快慢赋予每个省不同的颜色。 准备工作 我们需要先下载加拿大的省级行政区的底图。Global Administrative Areas (http://www.ga … 继续阅读“R语言教程之实现地图”

把表明时间序列的字符串转成时刻类型数据，在R言语里面有两个根本的函数：as.POSIXlt() 和 as.POSIXct()。两者都是S3泛型函数，依据参数的数据类型挑选不同的变换办法，除字符串外还能够变换数字、因子等数据类型，适应性很强： as.POSIXlt("2010/01/01") ## [1] "2010-01-01 CST" as.POSIXlt("2010/01/01 10:30:30&quo … 继续阅读“R语言教程之时间序列问题汇总实现代码教学”

1 R预设的调色板 这一系列函数有5个，即： rainbow heat.colors terrain.colors topo.colors cm.colors 在R环境外面输出问号（?）和下面任一函数名就可以取得这5个函数的用法阐明。这些函数最少需求一个参数，n，表示要失掉颜色的数量。n在零碎允许范围内没无限制。上面用彩虹色彩色板函数rainbow发生的颜色绘一个色盘： n <- 1000 png("rainbow.disc.png&quo … 继续阅读“R语言教程之调色板的使用”